RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219476.7

TSC2-201, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene TSC2, Length 6,156 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-201ENST00000219476 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 STARD6P59095 220 aa14.57□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 PSG6Q00889 435 aa14.57□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 RAB24Q969Q5 203 aa14.57□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 KBTBD11O94819 623 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 PRDX2P32119 198 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 C2orf83Q53S99 150 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 KCNK17Q96T54 332 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 C9orf170A2RU37 121 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 CD99P14209 185 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 GCAP28676 217 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 CKS2P33552 79 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 IER3P46695 156 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 CGB2Q6NT52 195 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 HIST1H4GQ99525 98 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 PLPP3O14495 311 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 HBZP02008 142 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 PGA4P0DJD7 388 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 PGA5P0DJD9 388 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 SPEF2Q9C093 1822 aa14.56□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 ANOS1P23352 680 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 PSG9Q00887 426 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 GABRA6Q16445 453 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 NKG7Q16617 165 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 C17orf51A8MQB3 221 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 LEUTXA8MZ59 168 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 MALP21145 153 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 AANATQ16613 207 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 CTF1Q16619 201 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 ERASQ7Z444 233 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 A0A0B4J2E0 115 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 A0A1B0GX12 115 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 SNURFLB1AK76 121 aa14.55□□□□□ -0.08
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TSC2-201ENST00000219476 CCL8P80075 99 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 OR2A7Q96R45 310 aa14.55□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.55□□□□□ -0.08
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TSC2-201ENST00000219476 RAB29O14966 203 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 PPP1R1AQ13522 171 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 OR6X1Q8NH79 312 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 NDUFB6O95139 128 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 IGKV3-20P01619 116 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 P2RY1P47900 373 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 ASB10Q8WXI3 467 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 RNF122Q9H9V4 155 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 J3QT63 122 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 FAM24BQ8N5W8 94 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 AESQ08117 197 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 LINC00596Q86U02 117 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 CCL13Q99616 98 aa14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 CLDN14O95500 239 aa14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 A1L4Q6 167 aa14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 IFNL4K9M1U5 179 aa14.53□□□□□ -0.08
TSC2-201ENST00000219476 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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