RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SOX14	O95416	240 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR75	O95800	540 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	EPPIN	O95925	133 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LALBA	P00709	142 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CPM	P14384	443 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ARR3	P36575	388 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TGFBR2	P37173	567 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RANBP1	P43487	201 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RGS6	P49758	472 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GFER	P55789	205 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	NCS1	P62166	190 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PAFAH1B2	P68402	229 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	UNC119	Q13432	240 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LTB4R	Q15722	352 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FHL5	Q5TD97	284 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	C12orf73	Q69YU5	71 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	USP43	Q70EL4	1123 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM156	Q8N614	296 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MORN4	Q8NDC4	146 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51A7	Q8NH64	312 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PIGX	Q8TBF5	258 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MGLL	Q99685	303 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGDIG	Q99819	225 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RSG1	Q9BU20	258 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SIAE	Q9HAT2	523 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM60A	Q9NP50	221 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087WUU8	490 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IRGM	A1A4Y4	181 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		J3QRK9	145 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R129	80 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CCRL2	O00421	344 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ALOX12B	O75342	701 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AQP8	O94778	261 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PTH	P01270	115 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35E2	P0CK97	266 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FOLR1	P15328	257 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GADD45A	P24522	165 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DSCR9	P59020	149 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTB	P60709	375 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1CA	P62136	330 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTG1	P63261	375 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK5	Q00535	292 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FUT5	Q11128	374 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPAN31	Q12999	210 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ECH1	Q13011	328 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	BIK	Q13323	160 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF726P1	Q15940	193 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF404	Q494X3	552 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HES3	Q5TGS1	186 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC34A3	Q8N130	599 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR31	Q8NA23	367 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5T1	Q8NG75	326 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MCFD2	Q8NI22	146 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CDS1	Q92903	461 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SDF2	Q99470	211 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SP140L	Q9H930	580 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AUP1	Q9Y679	476 aa		3.92	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms