RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630804.2

SPTAN1-222, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5 BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-222	ENST00000630804	CD81	P60033	236 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CDK5R1	Q15078	307 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	SPATA45	Q537H7	98 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	WBP1L	Q9NX94	342 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CKS2	P33552	79 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	SPSB1	Q96BD6	273 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	VAX2	Q9UIW0	290 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	ICOSLG	O75144	302 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CRH	P06850	196 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	OR5AC1	P0C628	307 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	MPL	P40238	635 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	DLK1	P80370	383 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	GUCA2A	Q02747	115 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	AQP6	Q13520	282 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	ISOC2	Q96AB3	205 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	IL4	P05112	153 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	PCP4	P48539	62 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	BTG2	P78543	158 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	SYS1	Q8N2H4	156 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	FAM222B	Q8WU58	562 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	TEX101	Q9BY14	249 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	SPTBN2	O15020	2390 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	KCNAB3	O43448	404 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	HR	O43593	1189 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	RECK	O95980	971 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	MPV17L	Q2QL34	196 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	MAVS	Q7Z434	540 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CACNA1B	Q00975	2339 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	C9orf172	C9J069	976 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	GPX5	O75715	221 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	IGLV3-27	P01718	113 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CD74	P04233	296 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	INHBB	P09529	407 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	GP1BA	P07359	652 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	FCGR3A	P08637	254 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	HKR1	P10072	659 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CDC20	Q12834	499 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	GUCD1	Q96NT3	240 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	C3orf80	F5H4A9	247 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	MOSPD3	O75425	235 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	IGHV3-13	P01766	116 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	IGHV3-7	P01780	117 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CDA	P32320	146 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804		A0A1W2PR48	441 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	ERVFRD-1	P60508	538 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	AWAT1	Q58HT5	328 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	OR4X1	Q8NH49	305 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	DDB2	Q92466	427 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	B3GALT4	O96024	378 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	HSF4	Q9ULV5	492 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	PAPPA	Q13219	1627 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	C9orf170	A2RU37	121 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	FRG2C	A6NGY1	282 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	CXorf1	O96002	111 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SPTAN1-222	ENST00000630804	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24

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