RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	BNIP1	Q12981	228 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1Q1	Q15612	314 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ESRG	Q1W209	222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CORO2A	Q92828	525 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	RERGL	Q9H628	205 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CALML5	Q9NZT1	146 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TXNL1	O43396	289 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TBX1	O43435	398 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM13	O60858	407 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL2	O95198	593 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	DUSP1	P28562	367 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CADM3	Q8N126	398 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PIGC	Q92535	297 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CPNE1	Q99829	537 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440		S4R3C0	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00473	A8K010	186 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	GYPC	P04921	128 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CHRNG	P07510	517 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC2A1	P11166	492 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MAS1L	P35410	378 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LGALS7	P47929	136 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CRISP3	P54108	245 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PKNOX1	P55347	436 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MEP1B	Q16820	701 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LTC4S	Q16873	150 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CDKL2	Q92772	493 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFA3	O95167	84 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	RBP1	P09455	135 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MYOD1	P15172	320 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	GNB3	P16520	340 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	VAMP1	P23763	118 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	INSL4	Q14641	139 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.03	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms