RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613864.4

TARDBP-215, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 4

Gene TARDBP, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-215	ENST00000613864	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	AP4M1	O00189	453 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	CCRL2	O00421	344 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	HSPB6	O14558	160 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	SSTR5	P35346	364 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	GLP1R	P43220	463 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	GNG10	P50151	68 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	RAB7A	P51149	207 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	PAX5	Q02548	391 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	FOXE3	Q13461	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	GPR50	Q13585	617 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	FLOT2	Q14254	428 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	POMP	Q9Y244	141 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864		H0YJX3	145 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ATP8B1	O43520	1251 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	FAM107A	O95990	144 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	LTC4S	Q16873	150 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ELP2	Q6IA86	826 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864		Q8NFD4	153 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	HSD17B6	O14756	317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	IGHG4	P01861	327 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ELANE	P08246	267 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF20	P17024	532 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	PSMB8	P28062	276 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	REG1B	P48304	166 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	CCR9	P51686	369 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	KISS1	Q15726	138 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	PELI1	Q96FA3	418 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	RCHY1	Q96PM5	261 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	CIB1	Q99828	191 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864		G3V2T6	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	VHL	P40337	213 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	MTNR1B	P49286	362 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	F2RL1	P55085	397 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	BNIP1	Q12981	228 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	TMED1	Q13445	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	S1PR3	Q99500	378 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	KLK15	Q9H2R5	256 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	NEK6	Q9HC98	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	LCE6A	A0A183	80 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864		I3L521	148 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	PIGY	Q3MUY2	71 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF691	Q5VV52	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	PXT1	Q8NFP0	134 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	OR11H1	Q8NG94	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	GNB4	Q9HAV0	340 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TARDBP-215	ENST00000613864	SLC16A6	O15403	523 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARDBP-215	ENST00000613864	MPZL2	O60487	215 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARDBP-215	ENST00000613864	IGF1	P05019	195 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARDBP-215	ENST00000613864	HTR1A	P08908	422 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TARDBP-215	ENST00000613864	CD1B	P29016	333 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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