RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 HAND1O96004 215 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 OR5AC1P0C628 307 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 GLRXP35754 106 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM187Q14656 261 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 WDR82Q6UXN9 313 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 FAM185AQ8N0U4 392 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 ELOVL5Q9NYP7 299 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 DUSP13Q9UII6 198 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 PCDHB10Q9UN67 800 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 RAXQ9Y2V3 346 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 MEMO1Q9Y316 297 aa11.66□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 TUSC2O75896 110 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 MSMPQ1L6U9 139 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 TOR2AQ5JU69 321 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF565Q8N9K5 539 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 OR11L1Q8NGX0 322 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 OR14J1Q9UGF5 321 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 ATMQ13315 3056 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 IFNA21P01568 189 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 IGHV3-13P01766 116 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 ESCO2Q56NI9 601 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 LRP11Q86VZ4 500 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 OR2Z1Q8NG97 314 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.65□□□□□ -0.54
FCHO1-221ENST00000597512 RNF222A6NCQ9 220 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 WNT9BO14905 357 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 GNRHRP30968 328 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 KCNJ3P48549 501 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 RBPJQ06330 500 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 SP6Q3SY56 376 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 SLC51BQ86UW2 128 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 GAPTQ8N292 157 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 DCUN1D4Q92564 292 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 CCKARP32238 428 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 CD200P41217 278 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 RAB14P61106 215 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 PCSK4Q6UW60 755 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 LRTM2Q8N967 370 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 RNF126Q9BV68 326 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa11.64□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 PET100P0DJ07 73 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 LMO1P25800 156 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 IL15RAQ13261 267 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 CLLU1Q5K131 121 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 C16orf97H3BN30 126 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 GPR31O00270 319 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 MPPED1O15442 326 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 BCL2L11O43521 198 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 B3GALNT1O75752 331 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 RND3P61587 244 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 VHLLQ6RSH7 139 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 KIRREL1Q96J84 757 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 GSX2Q9BZM3 304 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 TUBD1Q9UJT1 453 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 IGKV1-13P0DP09 117 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 LYL1P12980 280 aa11.63□□□□□ -0.55
FCHO1-221ENST00000597512 LGI3Q8N145 548 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms