RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 A6NNC1 897 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAPPC2LH3BP13 241 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 SPDEFO95238 335 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 CTXN2P0C2S0 81 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 M6PRP20645 277 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 GNG3P63215 75 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D28Q2M2D7 210 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXW12Q6X9E4 464 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 DCUN1D4Q92564 292 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF442Q9H7R0 627 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 NAA60Q9H7X0 242 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 IFT22Q9H7X7 185 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 DOCK7Q96N67 2140 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF732B4DXR9 585 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 KRBOX1C9JBD0 128 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 RLN2P04090 185 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 PI3P19957 117 aa21.63■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC30A7Q8NEW0 376 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 SFXN3Q9BWM7 321 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 TAAR5O14804 337 aa21.62■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZP3P21754 424 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBG1P23258 451 aa21.62■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A25Q6T423 547 aa21.62■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 NINJ1Q92982 152 aa21.62■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBG2Q9NRH3 451 aa21.62■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 A8MXK9 166 aa21.61■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 KNG1P01042 644 aa21.61■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS12P56730 875 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 KIR2DS1Q14954 304 aa21.61■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 WDR13Q9H1Z4 485 aa21.6■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 J3QT63 122 aa21.58■■□□□ 1.05
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CAPNS1-204ENST00000587718 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 CXorf58Q96LI9 332 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF581Q9P0T4 197 aa21.58■■□□□ 1.05
CAPNS1-204ENST00000587718 MED13LQ71F56 2210 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT19A8MXV4 375 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 DIRAS3O95661 229 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 CRYZL1O95825 349 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-204ENST00000587718 SMCO1Q147U7 214 aa21.57■■□□□ 1.04
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