RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575454.1

SMG6-218, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 652 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-218ENST00000575454 I3L521 148 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 TXNL1O43396 289 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 PRKYO43930 277 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 SNX3O60493 162 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 IGHV3-7P01780 117 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 IFNA6P05013 189 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 DBTP11182 482 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 SPNP16150 400 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 GZMHP20718 246 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 HTR1FP30939 366 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 GNG10P50151 68 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ZP1P60852 638 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 PAX5Q02548 391 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 GALEQ14376 348 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 UTF1Q5T230 341 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 AADACL4Q5VUY2 407 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 LYPD6Q86Y78 171 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 SGPP2Q8IWX5 399 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 C8orf31Q8N9H6 132 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 Q8N9W7 124 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 EME1Q96AY2 570 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 FGGYQ96C11 551 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 OR51J1Q9H342 316 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 FAM118AQ9NWS6 357 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 KIF25Q9UIL4 384 aa7□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 A8MZ25 164 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 H0YJX3 145 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 APOL3O95236 402 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 IGKV1D-12P01611 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ISG15P05161 165 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 OR8U9P0C7N5 309 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 PRKACGP22612 351 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ATP6V1E1P36543 226 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 REG1BP48304 166 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 MTNR1BP49286 362 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 LTC4SQ16873 150 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 RDH10Q8IZV5 341 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 LINC00311Q8N616 119 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 RFESDQ8TAC1 157 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 TMEM163Q8TC26 289 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 DCUN1D4Q92564 292 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ASB9Q96DX5 294 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 NRBF2Q96F24 287 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 MBOAT4Q96T53 435 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 SPATA25Q9BR10 227 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 FAM107BQ9H098 131 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.99□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 AQP12BA6NM10 295 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 B2RBV5 119 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 LINC01619G3V211 115 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 DCTN3O75935 186 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 TMEM225BP0DP42 221 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 RAB9AP51151 201 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 EFNB1P98172 346 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 MS4A2Q01362 244 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 CDK5R1Q15078 307 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 Q3ZCU0 254 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ELP2Q6IA86 826 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 RFT1Q96AA3 541 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 OR4C12Q96R67 309 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 TBX5Q99593 518 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.98□□□□□ -1.29
SMG6-218ENST00000575454 GNB4Q9HAV0 340 aa6.98□□□□□ -1.29
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