RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 FXYD4P59646 89 aa24.49■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 BET1O15155 118 aa24.49■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-208ENST00000573600 COL10A1Q03692 680 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC9A3R2Q15599 337 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCTD9Q7L273 389 aa24.47■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC01560Q8TB33 94 aa24.47■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF7Q9UBF6 113 aa24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 C17orf100A8MU93 164 aa24.46■■□□□ 1.51
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C5orf24Q7Z6I8 188 aa24.44■■□□□ 1.5
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CTDNEP1-208ENST00000573600 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD55Q3KP44 614 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM209AQ5JX71 171 aa24.42■■□□□ 1.5
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