RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.55□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.55□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.55□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 ATOH7Q8N100 152 aa9.55□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.55□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 TSSK2Q96PF2 358 aa9.55□□□□□ -0.88
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SEMA4B-204ENST00000558065 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 MS4A13Q5J8X5 152 aa9.54□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 AMZ2Q86W34 360 aa9.54□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.54□□□□□ -0.88
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SEMA4B-204ENST00000558065 WDR54Q9H977 334 aa9.54□□□□□ -0.88
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SEMA4B-204ENST00000558065 M0R1X1 148 aa9.53□□□□□ -0.88
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SEMA4B-204ENST00000558065 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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SEMA4B-204ENST00000558065 K7EP34 96 aa9.53□□□□□ -0.88
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SEMA4B-204ENST00000558065 IGLV3-25P01717 112 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 PPOXP50336 477 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 PIGPP57054 158 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SEMA4B-204ENST00000558065 TAF10Q12962 218 aa9.53□□□□□ -0.88
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