RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 COL12A1Q99715 3063 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 UBE2QL1A1L167 161 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SERPINE3A8MV23 424 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 H3BUI4 141 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 GABARAPH6UMI1 98 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SSX5O60225 188 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZNF737O75373 536 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CA11O75493 328 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 IGHV2-70P01814 119 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 GYPAP02724 150 aa6.69□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 PAX1P15863 534 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PRDX2P32119 198 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PRSS3P35030 304 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 BTG1P62324 171 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ARL6IP1Q15041 203 aa6.69□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 MICBQ29980 383 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 HACD4Q5VWC8 232 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 GPX8Q8TED1 209 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DYRK2Q92630 601 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SDSLQ96GA7 329 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 GAFA1Q96PS6 74 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CHODLQ9H9P2 273 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 TMEM165Q9HC07 324 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 GLS2Q9UI32 602 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 AK3Q9UIJ7 227 aa6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 USF3Q68DE3 2245 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 A0A1B0GW55 424 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SULT1C2O00338 296 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 HSPB6O14558 160 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 LANCL1O43813 399 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SSX4O60224 188 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 LPLP06858 475 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CD3GP09693 182 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CSF3P09919 207 aa6.68□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 IL7P13232 177 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SELLP14151 372 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 GABRA2P47869 451 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 OR3A1P47881 315 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ARFRP1Q13795 201 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 AVPI1Q5T686 147 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SHEQ5VZ18 495 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 Q8N402 240 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZNF561Q8N587 486 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZNF525Q8N782 197 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 OR52I2Q8NH67 350 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 BORCS5Q969J3 196 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 TRIM63Q969Q1 353 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CCL13Q99616 98 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CCDC32Q9BV29 185 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CHST6Q9GZX3 395 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PPA2Q9H2U2 334 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.68□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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