RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 GLIPR1P48060 266 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 BPIFB3P59826 476 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 GPR50Q13585 617 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TPBGQ13641 420 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 hADV38S2A0JD32 116 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MEIOCA2RUB1 952 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 NPFFO15130 113 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF728P0DKX0 622 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SRMP19623 302 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 COX7A1P24310 79 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 BMXP51813 675 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 DLX6P56179 175 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 LSAMPQ13449 338 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 AWAT2Q6E213 333 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 HCP5Q6MZN7 132 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TCF23Q7RTU1 214 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SPARTQ8N0X7 666 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 OSR2Q8N2R0 312 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PRR18Q8N4B5 295 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 Q8NFD4 153 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 THRSPQ92748 146 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MMP27Q9H306 513 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 BANF2Q9H503 90 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 LRRC42Q9Y546 428 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PPE2 198 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PR64 198 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PRV1 198 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 C17orf98A8MV24 154 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 SC5DO75845 299 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 UCHL1P09936 223 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 GTF2F2P13984 249 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 RAB6AP20340 208 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 OMGP23515 440 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PAX6P26367 422 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 SAA4P35542 130 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 UBE2E1P51965 193 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 P2RX3P56373 397 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 GABARAPL2P60520 117 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 FABP5Q01469 135 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 IL13RA2Q14627 380 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 SSX1Q16384 188 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 TAF9Q16594 264 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 Q6YL49 198 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 LYPD6Q86Y78 171 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CDH26Q8IXH8 852 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CHST4Q8NCG5 386 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 C17orf50Q8WW18 174 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 MISP3Q96FF7 219 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 COQ2Q96H96 371 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ZNF714Q96N38 554 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 IL36GQ9NZH8 169 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 FUOMA2VDF0 154 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 J3KRW8 73 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 M0QZ24 198 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CS-217ENST00000550044 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms