RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 DAPL1A0PJW8 107 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FGF16O43320 207 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 KDM4BO94953 1096 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 AMY1AP04745 511 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 AMY2AP04746 511 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 HCKP08631 526 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 HTR1AP08908 422 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 TMEM225BP0DP42 221 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 MYF6P23409 242 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 CAPGP40121 348 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 GLP1RP43220 463 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 THBS3P49746 956 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 RAB7AP51149 207 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 EFNB1P98172 346 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 MADCAM1Q13477 382 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 HNF4GQ14541 408 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 GPR141Q7Z602 305 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ZNF695Q8IW36 515 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 DDB2Q92466 427 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 CIB1Q99828 191 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 GON7Q9BXV9 100 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ZMAT4Q9H898 229 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 A0A087X0M5 115 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 A0A1B0GX30 115 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SNTNA6NMZ2 147 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 LY6LH3BQJ8 138 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 J3QR06 171 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 MAGEB3O15480 346 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 MT-ND2P03891 347 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 TFAP2AP05549 437 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 CSN2P05814 226 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SMIM18P0DKX4 95 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 EPHA2P29317 976 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 GDNFP39905 211 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 KIR3DL2P43630 455 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 VEGFCP49767 419 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 LTC4SQ16873 150 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 TEX38Q6PEX7 206 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SATL1Q86VE3 508 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 OR8H3Q8N146 312 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 CBR4Q8N4T8 237 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 DRAM1Q8N682 238 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 OR56B4Q8NH76 319 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SPACA5Q96QH8 159 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 GPER1Q99527 375 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 CALYQ9NYX4 217 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.69□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 J3QLW9 94 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 CCL24O00175 119 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 AP4M1O00189 453 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 IGKV1D-33P01593 117 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 IGKV1-33P01594 117 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 IGHV3-7P01780 117 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ISG15P05161 165 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ZNF19P17023 458 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms