RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 PIGYQ3MUY2 71 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.11□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 REC114Q7Z4M0 266 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 FGFRL1Q8N441 504 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM104Q8NE00 496 aa7.11□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.1□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV1-69P01742 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-212ENST00000541770 GLAP06280 429 aa7.1□□□□□ -1.27
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CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1W2PRM7 423 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 hADV38S2A0JD32 116 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 SMIM30A4D0T7 59 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC160A6NGH7 325 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 PDCD6O75340 191 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 RAB6AP20340 208 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 FUT3P21217 361 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 TGFBR1P36897 503 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 P2RX3P56373 397 aa7.08□□□□□ -1.28
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