RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 J3QR06 171 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 OPN1MWP04001 364 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 MAS1P04201 325 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 LPLP06858 475 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 FAM106CPP0CH98 169 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CGB3P0DN86 165 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CGB7P0DN87 165 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 GTF2F2P13984 249 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 GZMHP20718 246 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CD34P28906 385 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CAPGP40121 348 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 KCNJ3P48549 501 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 GPR176Q14439 515 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 Q499Y3 187 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CCDC107Q8WV48 283 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 LEAP2Q969E1 77 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 TOMM40LQ969M1 308 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 R3HDM4Q96D70 268 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 MMP28Q9H239 520 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 VCXQ9H320 206 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CALYQ9NYX4 217 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 A0A087X0M5 115 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 A0A1B0GX30 115 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PRX2 142 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 OOSP1A8MZH6 123 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 LY6LH3BQJ8 138 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MYL12BO14950 172 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 XPNPEP2O43895 674 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 GNAO1P09471 354 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 CELP19835 753 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 GNG10P50151 68 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R43P59537 309 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 HES1Q14469 280 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 UTF1Q5T230 341 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 AHSA2Q719I0 299 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 LINC00596Q86U02 117 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 Q8NFD4 153 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 OR14A2Q96R54 314 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 OR4F4Q96R69 305 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 IL36GQ9NZH8 169 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 PSG11Q9UQ72 335 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PP11 408 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PPE3 182 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 PTGES3LE9PB15 166 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 G3V4G9 280 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 OR2F2O95006 317 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 IL1AP01583 271 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 SSTR5P35346 364 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 WNT4P56705 351 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MADCAM1Q13477 382 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 HNF4GQ14541 408 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MPV17LQ2QL34 196 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 AWAT2Q6E213 333 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 DRAM1Q8N682 238 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms