RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MKXQ8IYA7 352 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAMD12Q8N8I0 201 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUP37Q8NFH4 326 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR8G5Q8NG78 346 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR5T2Q8NGG2 359 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR13G1Q8NGZ3 307 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEK7Q8TDX7 302 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPRL2Q8WTW4 380 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB40AQ8WXH6 277 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ST8SIA2Q92186 375 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM3DQ96BQ1 224 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 R3HDM4Q96D70 268 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C5orf30Q96GV9 206 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BARHL1Q9BZE3 327 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CST11Q9H112 138 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCB10Q9NRK6 738 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB22AQ9UL26 194 aa4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C5orf63A6NC05 138 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPRXA6NFQ7 191 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CBY3A6NI87 242 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF732B4DXR9 585 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAPPC2LH3BP13 241 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB27BO00194 218 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CTDSP2O14595 271 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HPGDSO60760 199 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KDM4BO94953 1096 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 S100A8P05109 93 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MELTFP08582 738 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF250P15622 560 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADRA2CP18825 462 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KITLGP21583 273 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CA6P23280 308 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACKR3P25106 362 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCKARP32238 428 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNFSF8P32971 234 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAS1LP35410 378 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNJ3P48549 501 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNG3P63215 75 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSG7Q13046 419 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FHL3Q13643 280 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBE2V2Q15819 145 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1orf100Q5SVJ3 147 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NCMAPQ5T1S8 102 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF529Q6P280 563 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STPG3Q8N7X2 389 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POC5Q8NA72 575 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR51A2Q8NGJ7 313 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNG3Q8TAE7 436 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPX8Q8TED1 209 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM222BQ8WU58 562 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM46BQ96A09 425 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PIK3IP1Q96FE7 263 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXXC4Q9H2H0 198 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLK3Q9H4B4 646 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LPAR2Q9HBW0 351 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAAR3PQ9P1P4 343 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GLS2Q9UI32 602 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FZR1Q9UM11 496 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DYSFO75923 2080 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0G2JK05 382 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HS3ST1O14792 307 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARPC5O15511 151 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KNG1P01042 644 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV3-13P01766 116 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HEXAP06865 529 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DNASE1P24855 282 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MPV17P39210 176 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTGFRP43088 359 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRP9P49458 86 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPM6AP51674 278 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLDN12P56749 244 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM33P57088 247 aa4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNFRSF9Q07011 255 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms