RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	AIP	O00170	330 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	BPNT1	O95861	308 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ARSB	P15848	533 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	P2RY14	Q15391	338 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	LTC4S	Q16873	150 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059		Q96M66	194 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SSR3	Q9UNL2	185 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059		V9GY05	133 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SLC17A2	O00624	439 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TOR1A	O14656	332 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SLC22A1	O15245	554 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	PDCD6	O75340	191 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	GAL	P22466	123 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	IER3	P46695	156 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	FAM189A2	Q15884	450 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF626	Q68DY1	528 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	LYPD6	Q86Y78	171 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR5R1	Q8NH85	324 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059		A0A087WXM4	84 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059		H3BUX3	64 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	IL1A	P01583	271 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RAB3B	P20337	219 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	FUT3	P21217	361 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	FOXL1	Q12952	345 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	HES5	Q5TA89	166 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	DYRK2	Q92630	601 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SSX3	Q99909	188 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM89	A2RUT3	159 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ODF3B	A8MYP8	253 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	HAX1	O00165	279 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	MMP23A	O75900	390 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	HKR1	P10072	659 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	GZMH	P20718	246 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	HTR1D	P28221	377 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SSTR5	P35346	364 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	PRRX1	P54821	245 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	CLDN12	P56749	244 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	PAX5	Q02548	391 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	SSX2	Q16385	188 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CHID1-222	ENST00000533059	C17orf50	Q8WW18	174 aa		11.24	□□□□□ -0.61

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