RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532885.5

RPS6KA4-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A4, human

TSL 3

Gene RPS6KA4, Length 902 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CPE	P16870	476 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SRM	P19623	302 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PAX6	P26367	422 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HTR1D	P28221	377 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM189A2	Q15884	450 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LY6E	Q16553	131 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PLA1A	Q53H76	456 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LYPD6	Q86Y78	171 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CALY	Q9NYX4	217 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885		H3BUI4	141 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TOR1A	O14656	332 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ARL6IP5	O75915	188 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IL1A	P01583	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CD34	P28906	385 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MAP2K4	P45985	399 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ARHGDIB	P52566	201 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	BANF2	Q9H503	90 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ANK2	Q01484	3957 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885		A0A087X0M5	115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885		A0A1B0GX30	115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM172BP	A6NC97	362 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NFYB	P25208	207 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GABRA5	P31644	462 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CEACAM3	P40198	252 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PRRX1	P54821	245 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885		Q6ZSV7	163 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LEUTX	A8MZ59	168 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	AIP	O00170	330 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	F2RL2	O00254	374 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TSPAN9	O75954	239 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CGB3	P0DN86	165 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CGB7	P0DN87	165 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GZMH	P20718	246 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HTR2C	P28335	458 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GDNF	P39905	211 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DYNLT3	P51808	116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RAB12	Q6IQ22	244 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM104	Q8NE00	496 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM46B	Q96A09	425 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885		Q96M66	194 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TCF19	Q9Y242	345 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MPIG6B	O95866	241 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms