RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 MEIKINA0A087WXM9 373 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINE3A8MV23 424 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 GLIPR1P48060 266 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 CR1LQ2VPA4 569 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SAMD12Q8N8I0 201 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 OR5H6Q8NGV6 325 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 WDFY2Q96P53 400 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 DIABLOQ9NR28 239 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 KIF25Q9UIL4 384 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF728P0DKX0 622 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 PLA2G7Q13093 441 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF273Q14593 569 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TPRX1Q8N7U7 411 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 PECRQ9BY49 303 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SIRPDQ9H106 197 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 OPN4Q9UHM6 478 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TOX4O94842 621 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 APOA1P02647 267 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM50BP56557 158 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 MOB1BQ7L9L4 216 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 UPRTQ96BW1 309 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-218ENST00000525459 UBE2QL1A1L167 161 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 DPPA5A6NC42 116 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 MFNGO00587 321 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 MMP9P14780 707 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 GLP1RP43220 463 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 ARF6P62330 175 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 C6orf183Q5T699 404 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 NCR3LG1Q68D85 454 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 BRICD5Q6PL45 260 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 TCF23Q7RTU1 214 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 BATF3Q9NR55 127 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 COMMD3Q9UBI1 195 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 C17orf98A8MV24 154 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 CLPXO76031 633 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 MT-ND4P03905 459 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 GZMHP20718 246 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 ERVFRD-1P60508 538 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 SCGB2A2Q13296 93 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 MOGAT2Q3SYC2 334 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 PLAC9Q5JTB6 97 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 FAM120AOSQ5T036 256 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 ING3Q9NXR8 418 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 A0A075B6Q4 140 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 DLX6P56179 175 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 PITPNAQ00169 270 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM30BQ3MIR4 351 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 NANPQ8TBE9 248 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 ORC5O43913 435 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 NAPSAO96009 420 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 CD3GP09693 182 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 CCL3L1P16619 93 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 PRTN3P24158 256 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 BPIFB3P59826 476 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 GUCA2AQ02747 115 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 OR52W1Q6IF63 320 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 VMO1Q7Z5L0 202 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 OR10A7Q8NGE5 316 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 OR13A1Q8NGR1 328 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 PCGF1Q9BSM1 259 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00574Q9H8X3 128 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 AK3Q9UIJ7 227 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 XRCC3O43542 346 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 HEPN1Q6WQI6 88 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 Q8N7P7 452 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 CALYQ9NYX4 217 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 A3GALT2U3KPV4 340 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-218ENST00000525459 GNB3P16520 340 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms