RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM17Q86X19 198 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 GAPTQ8N292 157 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 LILRB2Q8N423 598 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF561Q8N587 486 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 SDSLQ96GA7 329 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 MED30Q96HR3 178 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 SLC6A7Q99884 636 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 PRRT1Q99946 306 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 MMP28Q9H239 520 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 ING3Q9NXR8 418 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 A1L4Q6 167 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 K7N7A8 449 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 MGST3O14880 152 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFA2O43678 99 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFB6O95139 128 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 FSTL3O95633 263 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 GYPAP02724 150 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TFF1P04155 84 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TSPAN5P62079 268 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 PAX5Q02548 391 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 AESQ08117 197 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 KCNJ8Q15842 424 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 GLCCI1Q86VQ1 547 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CCL13Q99616 98 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 NUDT15Q9NV35 164 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 EHFQ9NZC4 300 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 FUOMA2VDF0 154 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SIGLEC5O15389 551 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 FABP7O15540 132 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 RP2O75695 350 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TK1P04183 234 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CTXN2P0C2S0 81 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 GSTT2P0CG29 244 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 OR5H8P0DN80 308 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 LYNX1P0DP58 116 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DAOP14920 347 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 RAG2P55895 527 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 BTG1P62324 171 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 IL13RA1P78552 427 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 Q6ZPA2 131 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TERB2Q8NHR7 220 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC107Q8WV48 283 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 UPRTQ96BW1 309 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 GAFA1Q96PS6 74 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 GINS4Q9BRT9 223 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 KIF25Q9UIL4 384 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ROS1P08922 2347 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 OVOL3O00110 214 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 TMPRSS2O15393 492 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-210ENST00000519815 DHFRP00374 187 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms