RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RFESDQ8TAC1 157 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LEAP2Q969E1 77 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC25A33Q9BSK2 321 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MMP28Q9H239 520 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL36GQ9NZH8 169 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV39A0A0B4J263 110 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EFCAB10A6NFE3 127 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OOSP1A8MZH6 123 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LY6LH3BQJ8 138 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL1AP01583 271 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM11P57052 281 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q499Y3 187 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YIF1BQ5BJH7 314 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NDUFA11Q86Y39 141 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPEQ96AT9 228 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OCSTAMPQ9BR26 566 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF581Q9P0T4 197 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 J3QR06 171 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAPGP40121 348 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC22A6Q4U2R8 563 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCA11PQ4W5N1 156 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NHLRC3Q5JS37 347 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATAD3CQ5T2N8 411 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOMM40LQ969M1 308 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 R3HDM4Q96D70 268 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PPK0 400 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 G3V4G9 280 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR2F2O95006 317 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAX5Q02548 391 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR5AU1Q8NGC0 362 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEK7Q8TDX7 302 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFT22Q9H7X7 185 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00574Q9H8X3 128 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSG11Q9UQ72 335 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLXNB1O43157 2135 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 XPNPEP2O43895 674 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPX5O75715 221 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LPLP06858 475 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNAO1P09471 354 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM106CPP0CH98 169 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GTF2F2P13984 249 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSTR5P35346 364 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNG10P50151 68 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAS2R43P59537 309 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBLN7Q53RD9 439 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00596Q86U02 117 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STX19Q8N4C7 294 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF485Q8NCK3 441 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR4F17Q8NGA8 305 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR10A7Q8NGE5 316 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PGLYRP3Q96LB9 341 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR14A2Q96R54 314 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR4F4Q96R69 305 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAGEA13PA6NCF6 341 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYL12BO14950 172 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GZMHP20718 246 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MADCAM1Q13477 382 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR176Q14439 515 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MPV17LQ2QL34 196 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C9orf152Q5JTZ5 239 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AHSA2Q719I0 299 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JAGN1Q8N5M9 183 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MUL1Q969V5 352 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PP11 408 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PRX2 142 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR10X1Q8NGY0 326 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC107Q8WV48 283 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 M0QZK8 103 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAS1P04201 325 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CELP19835 753 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FSTP19883 344 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LAIR2Q6ISS4 152 aa18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms