RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498801.5

GARNL3-222, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-222ENST00000498801 LGALS8O00214 317 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 IL1AP01583 271 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 IGHV2-70P01814 119 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SLPIP03973 132 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 HEXAP06865 529 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SFTPBP07988 381 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 UBBP0CG47 229 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 HTR2CP28335 458 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SERPINB10P48595 397 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 CAV3P56539 151 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 GPR176Q14439 515 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 RSU1Q15404 277 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 RAB11BQ15907 218 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 DGUOKQ16854 277 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 HES5Q5TA89 166 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 FAM166AQ6J272 317 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 USP43Q70EL4 1123 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 Q8IYB0 196 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 NDNFQ8TB73 568 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SLC25A28Q96A46 364 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SEH1LQ96EE3 360 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 METTL9Q9H1A3 318 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 IL36GQ9NZH8 169 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 GHRLQ9UBU3 117 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 ING4Q9UNL4 249 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 ZANQ9Y493 2812 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 DPPA5A6NC42 116 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 OR2AT4A6NND4 320 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 A8MXK9 166 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 CD5LO43866 347 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 CALCBP10092 127 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 ARSBP15848 533 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 PRKACAP17612 351 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SERPINA2P20848 420 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 BMXP51813 675 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 CLDN12P56749 244 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 FGF12P61328 243 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SPCS2Q15005 226 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 P2RY14Q15391 338 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 KCNJ8Q15842 424 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 MICBQ29980 383 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF404Q494X3 552 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 STUMQ69YW2 141 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 ELP2Q6IA86 826 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 Q8NFD4 153 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 GAL3ST1Q99999 423 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 CST11Q9H112 138 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM165Q9HC07 324 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 HMG20AQ9NP66 347 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 NLKQ9UBE8 527 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.11□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.11□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 A0A1W2PP11 408 aa6.11□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.11□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 TEX22C9J3V5 150 aa6.11□□□□□ -1.43
GARNL3-222ENST00000498801 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms