RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 UNC79Q9P2D8 2635 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 MED23Q9ULK4 1368 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 A0A0G2JMZ2 1700 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 ELP1O95163 1332 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 CLDN34H7C241 214 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 M0R1B8 84 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 NDUFS8O00217 210 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 NRASP01111 189 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 HRASP01112 189 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 KRASP01116 189 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 IGLV7-43P04211 117 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 OR4Q2P0C623 313 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SEC11BP0C7V7 166 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 PRKCDQ05655 676 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 ATP5G2Q06055 141 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 TRDNQ13061 729 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 XRCC4Q13426 336 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC26Q2I0M4 334 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 Q3ZCU0 254 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 LIN9Q5TKA1 542 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 TBPL2Q6SJ96 375 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 CLEC19AQ6UXS0 136 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC8AQ8IWT6 810 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 ATPAF2Q8N5M1 289 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 CCNYL1Q8N7R7 359 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SMIM8Q96KF7 97 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 OR2M4Q96R27 311 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SEC22CQ9BRL7 303 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 PRRG3Q9BZD7 231 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 DDIT4Q9NX09 232 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SDHAF2Q9NX18 166 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 TFR2Q9UP52 801 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 AP3M1Q9Y2T2 418 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 MAST4O15021 2626 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 PLXNB2O15031 1838 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF292O60281 2723 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 DLG5Q8TDM6 1919 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 OR6C70A6NIJ9 312 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 E7EWF7 191 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 TCAPO15273 167 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 CDK1P06493 297 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 IVLP07476 585 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 CCNOP22674 350 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 GPR4P46093 362 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 OR12D2P58182 307 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF678Q5SXM1 525 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 IDNKQ5T6J7 187 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 FAM131AQ6UXB0 335 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 NELFCDQ8IXH7 590 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 TCAIMQ8N3R3 496 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF680Q8NEM1 530 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SLC26A10Q8NG04 563 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 OR4K2Q8NGD2 314 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 OR6K2Q8NGY2 324 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 FAM57AQ8TBR7 257 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 C22orf15Q8WYQ4 148 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 CDKL2Q92772 493 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 ADTRPQ96IZ2 230 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 COPS4Q9BT78 406 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 HINT2Q9BX68 163 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SYT4Q9H2B2 425 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 USP24Q9UPU5 2620 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 CEP250Q9BV73 2442 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SPTBN2O15020 2390 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 DOCK1Q14185 1865 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 DOCK2Q92608 1830 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 DNAH14Q0VDD8 3507 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 FRYLO94915 3013 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 DMDP11532 3685 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1B0GUL6 1792 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 LOC285556D6RIA3 1793 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SLC5A10A0PJK1 596 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 RAB19A4D1S5 217 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 SC5DO75845 299 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 OR2A4O95047 310 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 CXorf1O96002 111 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 IGKV1D-16P01601 117 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 TGM4P49221 684 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-215ENST00000498284 IL15RAQ13261 267 aa2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms