RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	PSG11	Q9UQ72	335 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	EBAG9	O00559	213 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	IL1A	P01583	271 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CD2	P06729	351 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	SERPINA2	P20848	420 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	PPP3R1	P63098	170 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC58	Q4VC31	144 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618		Q6ZPA2	131 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OSR2	Q8N2R0	312 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	SGCD	Q92629	289 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	MYDGF	Q969H8	173 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	METTL9	Q9H1A3	318 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A1W2PP11	408 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OGG1	O15527	345 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	PF4V1	P10720	104 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	IGLL1	P15814	213 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CD33	P20138	364 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	DCK	P27707	260 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	BDKRB2	P30411	391 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	HES1	Q14469	280 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	HNF4G	Q14541	408 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618		Q8NFD4	153 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	OR52N1	Q8NH53	320 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	S100A13	Q99584	98 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATG4B-223	ENST00000493618	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A1W2PPI3	338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A1W2PPK0	400 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM11	P17152	192 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MYL12A	P19105	171 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MRAP	Q8TCY5	172 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	NEK7	Q8TDX7	302 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	GHSR	Q92847	366 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	SMIM19	Q96E16	107 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM80	Q96HE8	168 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	IRGM	A1A4Y4	181 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	PIN1P1	O15428	100 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	PF4	P02776	101 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	REG1B	P48304	166 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	KCNJ3	P48549	501 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MADCAM1	Q13477	382 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	RIPK1	Q13546	671 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	GGH	Q92820	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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