RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM213A2RRL7 107 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 H3BQ85 93 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 POP7O75817 140 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 PDPK2PQ6A1A2 396 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP82Q8N141 532 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF251Q9BRH9 671 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 EBPLQ9BY08 206 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 SMARCA4P51532 1647 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 EFCAB9A8MZ26 197 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 CYTH3O43739 400 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 RAB36O95755 333 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA13P48723 471 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 RAB8AP61006 207 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 SYNJ1O43426 1573 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM250H0YL14 139 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF235Q14590 738 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 OR7G1Q8NGA0 311 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP21Q9H596 190 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL3Q9UKT7 428 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 KIF21BO75037 1637 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 MYO15BQ96JP2 1530 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 VGLL3A8MV65 326 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 C9J4A7 227 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 TOR1AO14656 332 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 CETN3O15182 167 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF3P17036 446 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 CD34P28906 385 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 RCVRNP35243 200 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZQT7 251 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 MARCH3Q86UD3 253 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 DMAC2Q9NW81 257 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 HMGXB3Q12766 1538 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 SYNGR1O43759 233 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 TRGV3P03979 118 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 CRATP43155 626 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 STC1P52823 247 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 ABCG5Q9H222 651 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 OR51E2Q9H255 320 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL15Q9H469 300 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 BTRCQ9Y297 605 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 NUP205Q92621 2012 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 SSH2Q76I76 1423 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf51C9J302 202 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 D6RAR5 112 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 SMLR1H3BR10 107 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 GPR171O14626 319 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 FGF16O43320 207 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 MPZL2O60487 215 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 PDYNP01213 254 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-53P01767 116 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 PRPS1L1P21108 318 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K7CLP57077 242 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 MMDQ15546 238 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 ELP2Q6IA86 826 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 MUC15Q8N387 334 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM56Q96MV1 263 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 FAM210AQ96ND0 272 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS27Q9BQR3 290 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 IFT140Q96RY7 1462 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf65H3BRN8 121 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 GPR75O95800 540 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1D-33P01593 117 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1-33P01594 117 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 RD3LP0DJH9 198 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 ACTR1BP42025 376 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 DLX6P56179 175 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 CASP8Q14790 479 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 NIPAL1Q6NVV3 410 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-212ENST00000491302 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
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