RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL9	Q9H1A3	318 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL19	Q9UHD0	177 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB22A	Q9UL26	194 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	APC	P25054	2843 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CACNA1D	Q01668	2161 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM178B	H3BS89	294 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266		H7C417	338 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFNG	O00587	321 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAGEB3	O15480	346 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RGS5	O15539	181 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF737	O75373	536 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV4-39	P01824	125 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MELTF	P08582	738 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSG2	P11465	335 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX6B1	P14854	86 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNB3	P16520	340 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD40LG	P29965	261 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PEX19	P40855	299 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPOX	P50336	477 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ART1	P52961	327 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZMYND11	Q15326	602 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	AWAT1	Q58HT5	328 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	UTF1	Q5T230	341 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OSR2	Q8N2R0	312 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPERT	Q8NA61	448 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CMTM3	Q96MX0	182 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PECR	Q9BY49	303 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHODL	Q9H9P2	273 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEK6	Q9HC98	313 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM160	Q9NX00	188 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ETV7	Q9Y603	341 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDZD2	O15018	2839 aa		5.09	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLSCR5	A0PG75	271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM235	A6NFC5	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		A6NLC8	198 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM25A	B3EWG3	89 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM25C	B3EWG5	89 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM25G	B3EWG6	89 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RRH	O14718	337 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLA2G10	O15496	165 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	XRCC3	O43542	346 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSX4	O60224	188 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2H2	O95918	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCER2	P06734	321 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSF1	P09603	554 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD3G	P09693	182 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSF3	P09919	207 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBB	P0CG47	229 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTF2F2	P13984	249 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKACA	P17612	351 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GABRR1	P24046	479 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR3A1	P47881	315 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCP4	P48539	62 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PITPNB	P48739	271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SELENOV	P59797	346 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF146	Q15072	292 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RSU1	Q15404	277 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDNF	Q49AH0	187 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGAP6	Q5VW22	663 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	STUM	Q69YW2	141 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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