RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR8G5	Q8NG78	346 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PHB2	Q99623	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		Q9N2K0	584 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		A8MXE2	369 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		F8VVB4	439 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		F8VWA3	439 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	GOSR2	O14653	212 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SYNGR1	O43759	233 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC22A5	O76082	557 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	LYL1	P12980	280 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF250	P15622	560 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CA6	P23280	308 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	LMO1	P25800	156 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CD200	P41217	278 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNJ3	P48549	501 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	GMFB	P60983	142 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RND3	P61587	244 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NAAA	Q02083	359 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF154	Q13106	437 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF345	Q14585	488 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NMES1	Q9C002	83 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	LIME1	Q9H400	295 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		H7C1Q1	480 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R233	179 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MLNR	O43193	412 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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