RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 GPR137Q96N19 417 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FKBP11Q9NYL4 201 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CLN8Q9UBY8 286 aa11.67□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 DBX1A6NMT0 343 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 KIR3DL2P43630 455 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 WSB1Q9Y6I7 421 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 XKRY2A2RUG3 117 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OOEPA6NGQ2 149 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 AHRRA9YTQ3 701 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ZNHIT1O43257 154 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SYNGR2O43760 224 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PMELP40967 661 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 GUK1Q16774 197 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SKA3Q8IX90 412 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 GAPTQ8N292 157 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ANK1P16157 1881 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TXNDC12O95881 172 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 HPXP02790 462 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OR4A8P0C604 315 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OR5I1Q13606 314 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 IL13RA2Q14627 380 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF528Q3MIS6 628 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FAHD2AQ96GK7 314 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF488Q96MN9 340 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.66□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SFTPCP11686 197 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 BRS3P32247 399 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FAM3AP98173 230 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF665Q9H7R5 613 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OR5H1A6NKK0 313 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 GFRA3O60609 400 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM33P57088 247 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 C4orf17Q53FE4 359 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 KRTCAP3Q53RY4 240 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 C2CD4CQ8TF44 421 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SIP14410 1827 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PRR33A8MZF0 331 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PRSS44E7EML9 344 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PCOLCEQ15113 449 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 AANATQ16613 207 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OR8B2Q96RD0 313 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 KCNK17Q96T54 332 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.65□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PP11 408 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 G3V3Q6 166 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 IFI6P09912 130 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 RPL31P62899 125 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 AESQ08117 197 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 R3HDM4Q96D70 268 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 CXorf58Q96LI9 332 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 GOSR1O95249 250 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV3-11P04433 115 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 CXCL3P19876 107 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 SRP14P37108 136 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 TNXAQ16473 311 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 CLLU1Q5K131 121 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 CHRDL1Q9BU40 450 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 RNF24Q9Y225 148 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0U1RQV5 110 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 C17orf51A8MQB3 221 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 COX6A1P12074 109 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 GGTLC2Q14390 218 aa11.64□□□□□ -0.55
HDLBP-241ENST00000487169 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms