RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	LHX4	Q969G2	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		A0A0A6YYD4	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PRD5	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PRF3	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PRM7	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MYL12B	O14950	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SLC22A1	O15245	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CHST1	O43916	411 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TSPAN9	O75954	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CDRT1	O95170	752 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	HCK	P08631	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SRM	P19623	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SAA4	P35542	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GLIPR1	P48060	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	POU3F4	P49335	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	BAMBI	Q13145	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GPR176	Q14439	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TRAM1	Q15629	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TAF9	Q16594	264 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	DYRK2	Q92630	601 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MGLL	Q99685	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PPH5	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		A0A1W2PPK0	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ODAM	A1E959	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	DEGS1	O15121	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FBP1	P09467	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CAPZA1	P52907	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LOXL3	P58215	753 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FABP5	Q01469	135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	AES	Q08117	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FOXL1	Q12952	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	UNC119	Q13432	240 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GRK1	Q15835	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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