RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472897.5

RBM3-205, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 5

Gene RBM3, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-205	ENST00000472897	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	KIF25	Q9UIL4	384 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	SMIM30	A4D0T7	59 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	IGHV1-69	P01742	117 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	MT-ND4	P03905	459 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	GZMH	P20718	246 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	NICN1	Q9BSH3	213 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	ETAA1	Q9NY74	926 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF69	Q9UC07	566 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	HSF4	Q9ULV5	492 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	SOCS1	O15524	211 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	GABARAP	O95166	117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	TGFBR1	P36897	503 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	TMEM50B	P56557	158 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	PLA2G7	Q13093	441 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	CTF1	Q16619	201 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	GPR107	Q5VW38	600 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	HCP5	Q6MZN7	132 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	USP43	Q70EL4	1123 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	NEK7	Q8TDX7	302 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	ING3	Q9NXR8	418 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	SCOC	Q9UIL1	159 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM3-205	ENST00000472897	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897		A0A0A6YYJ9	748 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897		A0A0B4J203	849 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	VEGFC	P49767	419 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	EFNB2	P52799	333 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	VBP1	P61758	197 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	NCS1	P62166	190 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	OR52W1	Q6IF63	320 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897		Q6ZTK2	550 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	UBE2QL1	A1L167	161 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	POM121C	A8CG34	1229 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	ORC5	O43913	435 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	CLPX	O76031	633 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	SERPINB10	P48595	397 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	DLX1	P56177	255 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	MIDN	Q504T8	468 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	IDNK	Q5T6J7	187 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	CALY	Q9NYX4	217 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	ETV7	Q9Y603	341 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	JMJD1C	Q15652	2540 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	RAB27B	O00194	218 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	NPFF	O15130	113 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	PAH	P00439	452 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	CDK2	P24941	298 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	GLP1R	P43220	463 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	KLRD1	Q13241	179 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	DYRK2	Q92630	601 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	SLC6A7	Q99884	636 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM3-205	ENST00000472897	PECR	Q9BY49	303 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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