RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 BANF2Q9H503 90 aa7.41□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 GHRLQ9UBU3 117 aa7.41□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.41□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.41□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 FAM172BPA6NC97 362 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 VGLL3A8MV65 326 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 CD37P11049 281 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 MGMTP16455 207 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 GZMHP20718 246 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 NFYBP25208 207 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 HTR1DP28221 377 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 CD34P28906 385 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 GLP1RP43220 463 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 FABP5Q01469 135 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 PLA1AQ53H76 456 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZSV7 163 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 TMEM104Q8NE00 496 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 LINC01006Q8NI28 216 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 NDNFQ8TB73 568 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 ZNF596Q8TC21 504 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 SLITRK2Q9H156 845 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 Q9H521 79 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 CALYQ9NYX4 217 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.4□□□□□ -1.22
SYN3-211ENST00000472027 COL6A5A8TX70 2615 aa7.4□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 A0A087X0M5 115 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 A0A1B0GX30 115 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TOR1AO14656 332 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ARL6IP5O75915 188 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TSPAN9O75954 239 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 IGLV1-47P01700 117 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 MT-ND4P03905 459 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 UBBP0CG47 229 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 GABRA5P31644 462 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PRRX1P54821 245 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 GABARAPL2P60520 117 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 LTC4SQ16873 150 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 UTF1Q5T230 341 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR10K2Q6IF99 312 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RFESDQ8TAC1 157 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 NEK7Q8TDX7 302 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CCDC107Q8WV48 283 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM46BQ96A09 425 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 KIRREL1Q96J84 757 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 Q96M66 194 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CST11Q9H112 138 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 C16orf95Q9H693 158 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 DPM3Q9P2X0 92 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RNF114Q9Y508 228 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.39□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 A6NDX4 124 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 LEUTXA8MZ59 168 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SLC22A1O15245 554 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 MPIG6BO95866 241 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 IL1AP01583 271 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-7P01780 117 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.38□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 VSIG8P0DPA2 414 aa7.38□□□□□ -1.23
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