RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXL1Q12952 345 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 SSX2Q16385 188 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 MIDNQ504T8 468 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 NHLRC3Q5JS37 347 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 HEPN1Q6WQI6 88 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZPA2 131 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 LILRB2Q8N423 598 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 JAGN1Q8N5M9 183 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01006Q8NI28 216 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 RFESDQ8TAC1 157 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 MGLLQ99685 303 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF747Q9BV97 191 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM133Q9H2Q1 129 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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RABGEF1-206ENST00000461017 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R3Q9NYW6 316 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-206ENST00000461017 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPE3 182 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 LY6LH3BQJ8 138 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 C15orf65H3BRN8 121 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CLPXO76031 633 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA7O95182 113 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 MT-ND4P03905 459 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CD24P25063 80 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CD34P28906 385 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 SSTR5P35346 364 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 GLP1RP43220 463 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 RAG2P55895 527 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 PROK1P58294 105 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 UNC119Q13432 240 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR50Q13585 617 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM189A2Q15884 450 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 LTC4SQ16873 150 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 AWAT2Q6E213 333 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35E4Q6ICL7 350 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM219Q86XT9 240 aa5.64□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf56Q8N813 242 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CHST4Q8NCG5 386 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 OR13D1Q8NGV5 346 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC107Q8WV48 283 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 UFD1Q92890 307 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM46BQ96A09 425 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 KIRREL1Q96J84 757 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 Q96M66 194 aa5.64□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 VCX3BQ9H321 246 aa5.64□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087X0M5 115 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.63□□□□□ -1.51
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RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPH5 198 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2QL1A1L167 161 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 A6NDX4 124 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM14DPA8MWL7 114 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC31A2O15432 143 aa5.63□□□□□ -1.51
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