RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421051.1

AP000289.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000289.1, Length 1,361 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000289.1-201ENST00000421051 C1orf159Q96HA4 380 aa8.24□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.24□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 DECR2Q9NUI1 292 aa8.24□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.24□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.24□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 R4GMQ9 66 aa8.24□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 TGP01266 2768 aa8.24□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 E5RGE8 158 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CYR61O00622 381 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 HSD17B6O14756 317 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 GPR137BO60478 399 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 ZFAND5O76080 213 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 GCGP01275 180 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 IGKV1D-16P01601 117 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 IGHMP01871 453 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 PMP2P02689 132 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CSN2P05814 226 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 LINC00614P0C842 121 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CAMLGP49069 296 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 NPY4RP50391 375 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 DLK1P80370 383 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 PSG6Q00889 435 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 TNFRSF9Q07011 255 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 RAB35Q15286 201 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 MEP1BQ16820 701 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 PCK2Q16822 640 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 TSSK2Q96PF2 358 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CDH20Q9HBT6 801 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 C1orf123Q9NWV4 160 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 KIAA1456Q9P272 454 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 NSG2Q9Y328 171 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 ANK2Q01484 3957 aa8.23□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 SMCO3A2RU48 225 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 A8MXE2 369 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 H3BQ15 152 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 LMX1BO60663 402 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CXCL1P09341 107 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC35E2P0CK97 266 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 VSIG8P0DPA2 414 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CCL3P10147 92 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 TAS2R46P59540 309 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 PPA1Q15181 289 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 OR8G1Q15617 311 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 OR52N5Q8NH56 324 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF519Q8TB69 540 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 FGGYQ96C11 551 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 RAB39BQ96DA2 213 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 VSTM2LQ96N03 204 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 NELFAQ9H3P2 528 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 CALHM2Q9HA72 323 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 Q9N2J8 555 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
AP000289.1-201ENST00000421051 FREM3P0C091 2139 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms