RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409148.1

LRRTM1-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,126 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-202ENST00000409148 PSG7Q13046 419 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 WDR86Q86TI4 376 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM210A6NLX4 147 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 DEGS1O15121 323 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 TNFSF13O75888 250 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 AGFG2O95081 481 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF44P15621 663 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 OR8G1Q15617 311 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 Q6ZS92 163 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 RDH5Q92781 318 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 PIGMQ9H3S5 423 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-202ENST00000409148 ESPL1Q14674 2120 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 LINC00587B1AMM8 73 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 GPR31O00270 319 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 KLK10O43240 276 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 SRPXP78539 464 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 P2RY6Q15077 328 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 SVBPQ8N300 66 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM218A2RU14 115 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 MSGN1A6NI15 193 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 FAM209BQ5JX69 171 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 STARD4Q96DR4 205 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 C18orf12Q96KH6 178 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 RAB19A4D1S5 217 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 H7C1Q1 480 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 MPPED1O15442 326 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 TUSC2O75896 110 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 PGA5P0DJD9 388 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 MPV17P39210 176 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 ERVK11-1P61568 191 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 RND3P61587 244 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF154Q13106 437 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 HERPUD1Q15011 391 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 Q6P435 159 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 BEND4Q6ZU67 534 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM100Q9NV29 134 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 TREM2Q9NZC2 230 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 DEDDO75618 318 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 CGAP01215 116 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 GNRHRP30968 328 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 HLA-DRB3P79483 266 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 IGFBP7Q16270 282 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 BAP18Q8IXM2 172 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 OR8G5Q8NG78 346 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 NRIP2Q9BQI9 281 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 ZFP57Q9NU63 452 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 DLL1O00548 723 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 CDIPTO14735 213 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 TAAR5O14804 337 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 NXPH2O95156 264 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 SNAPINO95295 136 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM1-202ENST00000409148 IGLV1-44P01699 117 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms