RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR52W1Q6IF63 320 aa13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM91Q6ZNR0 172 aa13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABHD12Q8N2K0 398 aa13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MS4A15Q8N5U1 240 aa13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 NKAIN3Q8N8D7 197 aa13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM104Q8NE00 496 aa13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 THRSPQ92748 146 aa13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCN3BQ9NY72 215 aa13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 CALYQ9NYX4 217 aa13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 CKLFQ9UBR5 152 aa13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM172BPA6NC97 362 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP6V1G2O95670 118 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL1AP01583 271 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAS1P04201 325 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 UCHL1P09936 223 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 GTF2F2P13984 249 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 HLA-DRB5Q30154 266 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 ACSM3Q53FZ2 586 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLA1AQ53H76 456 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 C1orf100Q5SVJ3 147 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRSS48Q7RTY5 328 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHYHIPQ92561 330 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 Q96M66 194 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 GFI1Q99684 422 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 UQCC2Q9BRT2 126 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF702PQ9H963 129 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 ISYNA1Q9NPH2 558 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 ING3Q9NXR8 418 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TPRKBQ9Y3C4 175 aa13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MEIKINA0A087WXM9 373 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 C15orf65H3BRN8 121 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGS10O43665 173 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 HTR1DP28221 377 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 SSTR5P35346 364 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 GLP1RP43220 463 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSPA13P48723 471 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM189A2Q15884 450 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF497Q6ZNH5 498 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 JAGN1Q8N5M9 183 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 BARHL1Q9BZE3 327 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 DPM3Q9P2X0 92 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 NOTCH1P46531 2555 aa13.11□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRAV39A0A0B4J263 110 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A10PA6NDY2 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A18PA6NE21 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A16PA6NEW6 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A7PA6NKC0 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A12PA8MX19 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 CSTBP04080 98 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A15PP0C7V4 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A13PP0C7W8 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A14PP0C7W9 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A24PP0C7X0 464 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 QRFPP83859 136 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPR176Q14439 515 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MED22Q15528 200 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 LIPKQ5VXJ0 399 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 BRICD5Q6PL45 260 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR10A7Q8NGE5 316 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF596Q8TC21 504 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRGPRDQ8TDS7 321 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMED9Q9BVK6 235 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 VCX3BQ9H321 246 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAB18Q9NP72 206 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAB26Q9ULW5 256 aa13.1□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MT-ND4P03905 459 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MGMTP16455 207 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 CPEP16870 476 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 GABRA5P31644 462 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP2K4P45985 399 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 LOXL3P58215 753 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPS25P62851 125 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 AWAT2Q6E213 333 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 Q6ZS46 218 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM219Q86XT9 240 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF565Q8N9K5 539 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 NDNFQ8TB73 568 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 CFHR4Q92496 578 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 MMP28Q9H239 520 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 BANF2Q9H503 90 aa13.09□□□□□ -0.31
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa13.08□□□□□ -0.32
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.1 ms