RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 CD80P33681 288 aa12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 GABRA2P47869 451 aa12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ZFP69Q49AA0 526 aa12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 NLRC3Q7RTR2 1065 aa12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 TOMM40LQ969M1 308 aa12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 RASL12Q9NYN1 266 aa12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PRR13Q9NZ81 148 aa12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJB11Q9UBS4 358 aa12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 RNF115Q9Y4L5 304 aa12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.88□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 VSTM5A8MXK1 200 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 AADACP22760 399 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 TNFSF4P23510 183 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 VAMP1P23763 118 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 IL13RA1P78552 427 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 Q5BKY6 102 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 BEX5Q5H9J7 111 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 LYG2Q86SG7 212 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 TPRX1Q8N7U7 411 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DEFB108BQ8NET1 73 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM185AQ8NFB2 350 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 OR2AK2Q8NG84 335 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 CASTOR1Q8WTX7 329 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 RNF7Q9UBF6 113 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 M0R233 179 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 CLDN14O95500 239 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 MDH2P40926 338 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 OR3A1P47881 315 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DHODHQ02127 395 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 NOXA1Q86UR1 476 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 GAPTQ8N292 157 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PRR18Q8N4B5 295 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SPICQ8N5J4 248 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 COQ2Q96H96 371 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 FXYD6Q9H0Q3 95 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DLL4Q9NR61 685 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DECR2Q9NUI1 292 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 PIPOXQ9P0Z9 390 aa12.87□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DCHS2Q6V1P9 2916 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 IFNL4K9M1U5 179 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 GOSR2O14653 212 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SLC22A5O76082 557 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 H2BFSP57053 126 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM128Q5BJH2 165 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DCAF12L2Q5VW00 463 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SHEQ5VZ18 495 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 KIRREL1Q96J84 757 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SCGB3A2Q96PL1 93 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 KIF25Q9UIL4 384 aa12.86□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF728P0DKX0 622 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ANXA3P12429 323 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 GLIPR1P48060 266 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SLC9A3R2Q15599 337 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 KCNJ8Q15842 424 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ZNRF1Q8ND25 227 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 IL1F10Q8WWZ1 152 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DCTN5Q9BTE1 182 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 BOLA1Q9Y3E2 137 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 NPTNQ9Y639 398 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GW55 424 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 C19orf84I3L1E1 186 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF737O75373 536 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 CD55P08174 381 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ADH4P08319 380 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DUX4L2P0CJ85 424 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DUX4L3P0CJ86 424 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DUX4L4P0CJ87 422 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DUX4L5P0CJ88 424 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DUX4L6P0CJ89 424 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DUX4L7P0CJ90 424 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 SELLP14151 372 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 CD34P28906 385 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 KIR2DS4P43632 304 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 HLA-DRB3P79483 266 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 KIR2DS1Q14954 304 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC18BQ6UXF7 455 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD9Q7L273 389 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 OR11H4Q8NGC9 324 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 ANGPTL6Q8NI99 470 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 MOB3AQ96BX8 217 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 FAHD2AQ96GK7 314 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 DUX4Q9UBX2 424 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 MAB21L2Q9Y586 359 aa12.85□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa12.84□□□□□ -0.35
CASQ1-201ENST00000368078 FAM172BPA6NC97 362 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms