RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 H3BMM0 161 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 I3L4J1 428 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 COCHO43405 550 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCF21O43680 179 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP6V1G2O95670 118 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGKV1D-12P01611 117 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGLV3-19P01714 112 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTLA4P16410 223 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HLA-DMAP28067 261 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C4orf26Q17RF5 130 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 COMTD1Q86VU5 262 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LYPD6Q86Y78 171 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 YIPF7Q8N8F6 280 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR11G2Q8NGC1 345 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MUC7Q8TAX7 377 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDI1Q8WTU0 396 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBE2WQ96B02 151 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR22Q99680 433 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 EBPLQ9BY08 206 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 INIPQ9NRY2 104 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DMAC2Q9NW81 257 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 VWA8A3KMH1 1905 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CRB1P82279 1406 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SVILO95425 2214 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 THADAQ6YHU6 1953 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR6C70A6NIJ9 312 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARGFXA6NJG6 315 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C9J4A7 227 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 K7ERS5 55 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB36O95755 333 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 COL8A2P25067 703 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSMB6P28072 239 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 COILP38432 576 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACTR1BP42025 376 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB8AP61006 207 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDGFRLQ15198 375 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF141Q15928 474 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 EXOC3L4Q17RC7 722 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM249Q2WGJ8 235 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEFB134Q4QY38 66 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LCE1CQ5T751 118 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM215Q68D42 235 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NIPAL1Q6NVV3 410 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPNS3Q6ZMD2 512 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD302Q8IX05 232 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MSRB3Q8IXL7 192 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MUC15Q8N387 334 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC25A45Q8N413 288 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR7G1Q8NGA0 311 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR5D18Q8NGL1 313 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 B9D2Q9BPU9 175 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1orf50Q9BV19 199 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR2D2Q9H210 308 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNIP2Q9NS61 270 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1orf109Q9NX04 203 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HMGXB4Q9UGU5 601 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF391Q9UJN7 358 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAP3K19Q56UN5 1328 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR5H14A6NHG9 310 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 METTL15A6NJ78 407 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 F8VZ95 297 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 K7EQS6 105 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP8B1O43520 1251 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF708P17019 499 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNTFRP26992 372 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSMB9P28065 219 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD40LGP29965 261 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CBX5P45973 191 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 STC1P52823 247 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOXA1P55317 472 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DLX6P56179 175 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CASP8Q14790 479 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 BCL2A1Q16548 175 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MESTQ5EB52 335 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CENPWQ5EE01 88 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM162BQ5T6X4 162 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 EBLN2Q6P2I7 272 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PP632Q6XCG6 107 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SSX7Q7RTT5 188 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM9CQ8IZT9 166 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR9I1Q8NGQ6 314 aa1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms