RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 SOCS1O15524 211 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ARG1P05089 322 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 HLA-DRB3P79483 266 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF616Q08AN1 781 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 OR5AP2Q8NGF4 316 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ADGRG7Q96K78 797 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 OBSL1O75147 1896 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 K7N7A8 449 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ARPC5O15511 151 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 DTYMKP23919 212 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 TGFBR1P36897 503 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 CAMLGP49069 296 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 GUCA2AQ02747 115 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM230Q96A57 120 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 SEC22AQ96IW7 307 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 HYLS1Q96M11 299 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ODAMA1E959 279 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 OR2H2O95918 312 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 LALBAP00709 142 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 RRASP10301 218 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 HTR1DP28221 377 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 LGALS7P47929 136 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 MMP15P51511 669 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF561Q8N587 486 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 RFLNBQ8N5W9 214 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 PRB1P04280 392 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 BTG1P62324 171 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 BAMBIQ13145 260 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 DDOQ99489 341 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 KLK11Q9UBX7 282 aa9.26□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 SEMA7AO75326 666 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 LYPD3O95274 346 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 FAM106CPP0CH98 169 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ADRA2CP18825 462 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 IL24Q13007 206 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 IRF3Q14653 427 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 POFUT1Q9H488 388 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 BAXQ07812 192 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF154Q13106 437 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 Q6ZRG5 221 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 JMJD8Q96S16 334 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 AK3Q9UIJ7 227 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 LEUTXA8MZ59 168 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 LY86O95711 162 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 PDGFAP04085 211 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 GABRB1P18505 474 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 CRYGSP22914 178 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 MMDQ15546 238 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 OR8H3Q8N146 312 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 MARVELD3Q96A59 401 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 PTX4Q96A99 478 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 MYO18BQ8IUG5 2567 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.25□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 THBS3P49746 956 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 SIRT7Q9NRC8 400 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 K7EM74 188 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 DFFBO76075 338 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 CRYZL1O95825 349 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 LPAR6P43657 344 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 POM121Q96HA1 1249 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 FREM3P0C091 2139 aa9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SEC24C-201ENST00000339365 A0A1W2PN81 502 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms