RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323319.6

CLDN22-201, Transcript of claudin 22, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN22, Length 2,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22-201ENST00000323319 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 TTTY12Q9BZ98 90 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 GPR61Q9BZJ8 451 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 SMIM3Q9BZL3 60 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 MED13Q9UHV7 2174 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 C21orf140B9A014 251 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 K7EPK0 472 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 TCAPO15273 167 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ZNHIT1O43257 154 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PDCD6O75340 191 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 SP9P0CG40 484 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF728P0DKX0 622 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 RBM11P57052 281 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 FXYD4P59646 89 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 MALLQ13021 153 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 COLCA1Q6ZS62 124 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 SLC25A26Q70HW3 274 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 BATF2Q8N1L9 274 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 FBXO7Q9Y3I1 522 aa13.26□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HLA-HP01893 362 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 SOD3P08294 240 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 CD59P13987 128 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF708P17019 499 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 TMEM33P57088 247 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 KHDC3LQ587J8 217 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 OR56B2PQ8NGI1 322 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 TMED3Q9Y3Q3 217 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PPP1R2P9O14990 202 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 IFNA21P01568 189 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 DANCRP0C864 163 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 CCL2P13500 99 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 RAB4BP61018 213 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ABCA11PQ4W5N1 156 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PDZD11Q5EBL8 140 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 GGNBP1Q5YKI7 109 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PRRG4Q9BZD6 226 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF286AQ9HBT8 521 aa13.25□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 FAM186AA6NE01 2351 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST1H2BKO60814 126 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST1H2BJP06899 126 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST1H2BOP23527 126 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST1H2BBP33778 126 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 NPBWR2P48146 333 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 CASP6P55212 293 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST1H2BDP58876 126 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST1H2BCP62807 126 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PLGLB1Q02325 96 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST2H2BEQ16778 126 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 TMEM251Q8N6I4 163 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST1H2BHQ93079 126 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST1H2BNQ99877 126 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 HIST1H2BMQ99879 126 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF442Q9H7R0 627 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 KMT2EQ8IZD2 1858 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 C5orf49A4QMS7 147 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 CAMLGP49069 296 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 FHITP49789 147 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 LUZP4Q9P127 313 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa13.24□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF727A8MUV8 499 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 SFTPCP11686 197 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PAX1P15863 534 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 FUT3P21217 361 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 SP6Q3SY56 376 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PBDC1Q9BVG4 233 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 NAA60Q9H7X0 242 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 OR5H1A6NKK0 313 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 MT-CO3P00414 261 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 CXCL1P09341 107 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 OR5AC1P0C628 307 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PHLDA2Q53GA4 152 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 SOHLH1Q5JUK2 328 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 Q6ZPA2 131 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 C19orf12Q9NSK7 152 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 IL17BQ9UHF5 180 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 TUBD1Q9UJT1 453 aa13.23□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 ZNF724A8MTY0 619 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 M0R296 226 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 PRDX4Q13162 271 aa13.22□□□□□ -0.29
CLDN22-201ENST00000323319 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms