RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 A0A1B0GU03 582 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 TMEM210A6NLX4 147 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 NUDT8Q8WV74 236 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 CXCL10P02778 98 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 RAG2P55895 527 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 SP6Q3SY56 376 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 RNF122Q9H9V4 155 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 NAT8Q9UHE5 227 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 OR5AC1P0C628 307 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 REC114Q7Z4M0 266 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 CT55Q8WUE5 264 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 H3BVH4 76 aa8.26□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PR80 420 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 COL19A1Q14993 1142 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 TBX21Q9UL17 535 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 SFT2D2O95562 160 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 LIMK1P53667 647 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ADIPOQQ15848 244 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 GUCA2AQ02747 115 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 IGLV3-25P01717 112 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 PATJQ8NI35 1801 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 CCL21O00585 134 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 SOCS7O14512 581 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 SPEM2Q0P670 501 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 R3HDM4Q96D70 268 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 C12orf57Q99622 126 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 DOK5Q9P104 306 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 TBX19O60806 448 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 CAMPP49913 170 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 MZB1Q8WU39 189 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 RABAC1Q9UI14 185 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 PLPP3O14495 311 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 SPINK4O60575 86 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 NDUFB6O95139 128 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 INHBBP09529 407 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 GALNSP34059 522 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 CLDN18P56856 261 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 BCORQ6W2J9 1755 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 CD99P14209 185 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 C12orf73Q69YU5 71 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 J3KRW8 73 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 COX6CP09669 75 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 IFT22Q9H7X7 185 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 C16orf97H3BN30 126 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ETHE1O95571 254 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.25□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ANK1P16157 1881 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 NKX2-2O95096 273 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 GABRG2P18507 467 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ZXDAP98168 799 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 DHRS13Q6UX07 377 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 STPG3Q8N7X2 389 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 RFESDQ8TAC1 157 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 H3BMH7 237 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 P2RX4Q99571 388 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 TGFBR1P36897 503 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ZNF117Q03924 483 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.24□□□□□ -1.09
CUX1-201ENST00000292535 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms