RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 PSG2P11465 335 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 AKR1C4P17516 323 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 VAMP1P23763 118 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 FCGR2CP31995 323 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 GABRA2P47869 451 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 FXYD4P59646 89 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 HERV-K104P61576 105 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 DHRS2Q13268 280 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 ZFP69Q49AA0 526 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 LYG2Q86SG7 212 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 MUC15Q8N387 334 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 TOMM40LQ969M1 308 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 GPR132Q9UNW8 380 aa6.97□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 B8ZZF3 427 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 BET1O15155 118 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 ZNF205O95201 554 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 DIRAS3O95661 229 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 LHBP01229 141 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 PPYP01298 95 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 TK1P04183 234 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 PRB1P04280 392 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 SCTP09683 121 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 CTXN2P0C2S0 81 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 ZNF728P0DKX0 622 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 CXCL3P19876 107 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 CD34P28906 385 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 PRDX2P32119 198 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 OR3A1P47881 315 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 PPP1R1AQ13522 171 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 IGSF11Q5DX21 431 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 C11orf88Q6PI97 169 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 GAPTQ8N292 157 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 CD177Q8N6Q3 437 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 MOB3AQ96BX8 217 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.96□□□□□ -1.29
COPS4-201ENST00000264389 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 FAM172BPA6NC97 362 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 OOEPA6NGQ2 149 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 GOSR2O14653 212 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 PI3P19957 117 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 AADACP22760 399 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 ZBTB25P24278 435 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 IL13RA1P78552 427 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 AESQ08117 197 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 HERPUD1Q15011 391 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 HMGN3Q15651 99 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 FAM201AQ5SY85 155 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 PRR18Q8N4B5 295 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 SPICQ8N5J4 248 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 FAM222BQ8WU58 562 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 TMEM230Q96A57 120 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 COQ2Q96H96 371 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 KIRREL1Q96J84 757 aa6.96□□□□□ -1.3
COPS4-201ENST00000264389 SNX22Q96L94 193 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms