RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000052747.3

Nhlrc1-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Nhlrc1, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm1673Q3UR78 90 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Vmn1r173E9Q8V7 313 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm4778L7N229 365 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Avpr2O88721 371 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Sdc1P18828 311 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Fndc4Q3TR08 231 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Scarb1Q61009 509 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Orm3Q63805 206 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tssk5Q8C1R0 372 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr1451Q8VFX5 310 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Rfpl4aQ8VH31 287 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Clec6aQ9JKF4 209 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 MioxQ9QXN5 285 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 FaimQ9WUD8 179 aa20.47■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm45716A0A1B0GRQ0 93 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm42957D6RFQ2 366 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr936J3KMV2 267 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 EnamO55196 1274 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Hoxb5P09079 269 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Rps2P25444 293 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Adra2cQ01337 458 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Mpzl1Q3TEW6 270 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr774Q7TRI5 312 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Rnf144bQ8BKD6 301 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Spata2lQ8BNN1 426 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Calhm2Q8VEC4 323 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Dnajc24Q91ZF0 196 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ms4a8Q99N10 290 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm12355A2A4X6 163 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Fam98cE9PYD1 344 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm8882E9Q7E4 283 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm9772F6XPD8 135 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 P01795 144 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Srsf3P84104 164 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 TrmoQ562D6 431 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr775Q7TRI4 312 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tm2d3Q8BJ83 261 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Nfam1Q8R4V1 264 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Pcdhga3Q91XY5 928 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ddb2Q99J79 432 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 P2ry4Q9JJS7 361 aa20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Actl6aQ9Z2N8 429 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Itga5P11688 1053 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 PpiaP17742 164 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 DaoP18894 345 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cdx2P43241 311 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 AtraidQ6PGD0 223 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 PurgQ8R4E6 350 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr24Q8VFM9 313 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr1132Q8VG97 308 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Rnf141Q99MB7 230 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ms4a4dQ99N05 225 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Lyzl6Q9DA11 148 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Mcts1Q9DB27 181 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Fbxw4Q9JMJ2 410 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 TsnaxQ9QZE7 290 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Adam11Q9R1V4 773 aa20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ighv1-42A0A0A6YY38 117 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm21981D3Z6Q6 369 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Yjefn3F6W8I0 251 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Srsf5O35326 269 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gfi1bO70237 330 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Il7rP16872 459 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Hoxb1P17919 297 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Taf9bQ6NZA9 249 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 RflnaQ7TS73 204 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tbl1xr1Q8BHJ5 514 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tox4Q8BU11 619 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 PipoxQ9D826 390 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm5493S4R2D1 92 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Prrt2E9PUL5 346 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Arg2O08691 354 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Wsb1O54927 421 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Wnt2bO70283 389 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Mdh2P08249 338 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gabrr1P56475 480 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Wdr34Q5U4F6 535 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gpr173Q6PI62 373 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Opn5Q6VZZ7 377 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr361Q8VF16 322 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Opn4Q9QXZ9 521 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Rev3lQ61493 3122 aa20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Sult2a4L7N245 285 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Hist1h1dP43277 221 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Slc38a11Q3USY0 453 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Sec14l3Q5SQ27 401 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Vmn1r235Q8R297 328 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Vmn1r138D3YTY2 306 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm8693E9PW18 306 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm4498K9J7G4 306 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Vmn1r118L7N273 306 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Rnase2bO35292 155 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Pate2Q3UW31 111 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Fbxw20Q5U467 468 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Zfp975Q6NVD6 525 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr1173Q7TR24 312 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr1377Q8VGH1 307 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 RetnlaQ9EP95 111 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Elp4Q9ER73 422 aa20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Eif3iQ9QZD9 325 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.3 ms