RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 C20orf204Q6ZNR8 217 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf107Q6ZR85 190 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRT1Q99946 306 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 C20orf85Q9H1P6 137 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF286AQ9HBT8 521 aa20.85■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR3A3P47888 321 aa20.84■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 H7C1Q1 480 aa20.83■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0B4J293 547 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF205O95201 554 aa20.83■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 BCAP31P51572 246 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 OR13C8Q8NGS7 320 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 GINS4Q9BRT9 223 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 EHFQ9NZC4 300 aa20.83■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 FLVCR2Q9UPI3 526 aa20.83■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35E4Q6ICL7 350 aa20.81■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 SNX22Q96L94 193 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB1BQ9H0U4 201 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 UBTD1Q9HAC8 227 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 NECAP2Q9NVZ3 263 aa20.81■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 PPIAL4DF5H284 164 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN5P62079 268 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 TATDN3Q17R31 274 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 MAB21L2Q9Y586 359 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 MOB1BQ7L9L4 216 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-215ENST00000628018 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC18AA5D8T8 446 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 K7N7A8 449 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 PEX14O75381 377 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 AESQ08117 197 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 HFEQ30201 348 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC18BQ6UXF7 455 aa20.78■□□□□ 0.92
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