RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 DANCRP0C864 163 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 LTC4SQ16873 150 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 SPINK14Q6IE38 97 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 OR6C6A6NF89 314 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 H3BQ15 152 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 SIRPB1O00241 398 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 IGKV1D-12P01611 117 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 RFPL3SP0C7P2 107 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 CYB561P49447 251 aa11.95□□□□□ -0.5
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HPS1-215ENST00000613394 IL13RA2Q14627 380 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 C3AR1Q16581 482 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 MPV17LQ2QL34 196 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.95□□□□□ -0.5
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HPS1-215ENST00000613394 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.95□□□□□ -0.5
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HPS1-215ENST00000613394 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.94□□□□□ -0.5
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HPS1-215ENST00000613394 SRPXP78539 464 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 ADIRFQ15847 76 aa11.94□□□□□ -0.5
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HPS1-215ENST00000613394 TDHQ8IZJ6 230 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.94□□□□□ -0.5
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HPS1-215ENST00000613394 PRR14LQ5THK1 2151 aa11.94□□□□□ -0.5
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HPS1-215ENST00000613394 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.94□□□□□ -0.5
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HPS1-215ENST00000613394 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 GRPP07492 148 aa11.92□□□□□ -0.5
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HPS1-215ENST00000613394 RAB1AP62820 205 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 COMMD1Q8N668 190 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 NABP1Q96AH0 204 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 GPR35Q9HC97 309 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 CACNG5Q9UF02 275 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 GAB2Q9UQC2 676 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 CADP27708 2225 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 A0A0U1RQK1 487 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 KIR2DS4P43632 304 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HPS1-215ENST00000613394 KIR2DS1Q14954 304 aa11.91□□□□□ -0.5
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