RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602632.1

UBE2E3-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, human

TSL 2 BASIC

Gene UBE2E3, Length 446 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2E3-208	ENST00000602632	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MMP23A	O75900	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	TMEM11	P17152	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CD34	P28906	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MAGEA2	P43356	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MNAT1	P51948	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	P2RX3	P56373	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	APOF	Q13790	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	GK3P	Q14409	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CORO2A	Q92828	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	RPE	Q96AT9	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FEV	Q99581	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632		R4GMQ9	66 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	LCE6A	A0A183	80 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632		F8VVB4	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632		F8VWA3	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SIRPB1	O00241	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	GNGT2	O14610	69 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SH2D1B	O14796	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FGF16	O43320	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SYT7	O43581	403 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	IGHG2	P01859	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OSM	P13725	252 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	PRKACA	P17612	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SLC2A5	P22732	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	NFYB	P25208	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	DUSP1	P28562	367 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	PTGFR	P43088	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	RBP2	P50120	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ATP1B3	P54709	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CDC42	P60953	191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CDK5	Q00535	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	AES	Q08117	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	BNIP1	Q12981	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF146	Q15072	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632		Q6ZSR3	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	STPG2	Q8N412	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2E3-208	ENST00000602632	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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