RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 FUT3P21217 361 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 BLMHQ13867 455 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CR1LQ2VPA4 569 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 OR10K2Q6IF99 312 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CORO2AQ92828 525 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM46BQ96A09 425 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 ISOC1Q96CN7 298 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 NICN1Q9BSH3 213 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 PPA2Q9H2U2 334 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 RAB22AQ9UL26 194 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 HSF4Q9ULV5 492 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A0A6YYH2 397 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A0B4J203 849 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 hADV38S2A0JD32 116 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 SMIM30A4D0T7 59 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 A6NJ64 397 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 POM121CA8CG34 1229 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 C17orf98A8MV24 154 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 H3BMQ9 156 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 RAB27BO00194 218 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 SCGNO76038 276 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 NAPSAO96009 420 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CGB3P0DN86 165 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CGB7P0DN87 165 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 SERPINB10P48595 397 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 EFNB2P52799 333 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 MXD1Q05195 221 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 PLA2G7Q13093 441 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF273Q14593 569 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 RAB12Q6IQ22 244 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 Q8N7P7 452 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 NDNFQ8TB73 568 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 TNFRSF14Q92956 283 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 TBX15Q96SF7 602 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CHST6Q9GZX3 395 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 SPATA2Q9UM82 520 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1W2PPH5 198 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 MFNGO00587 321 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CLPXO76031 633 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 PAHP00439 452 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 AVPP01185 164 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF728P0DKX0 622 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 HNF1AP20823 631 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 PRTN3P24158 256 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 GLIPR1P48060 266 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM50BP56557 158 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 EDDM3BP56851 147 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 AESQ08117 197 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 CMTM3Q96MX0 182 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF714Q96N38 554 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms