RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 GZMHP20718 246 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 BCL3P20749 454 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ECI1P42126 302 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 VEGFCP49767 419 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 NPY4RP50391 375 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TAS2R20P59543 309 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ERVFRD-1P60508 538 aa6.16□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 UNC119Q13432 240 aa6.16□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 MEF2DQ14814 521 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 KIR3DS1Q14943 382 aa6.16□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 H0YL77 283 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 C19orf84I3L1E1 186 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 TAF9Q16594 264 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 CD276Q5ZPR3 534 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 SDSLQ96GA7 329 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMAD4-210ENST00000590061 BANF2Q9H503 90 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MIOXQ9UGB7 285 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 USF3Q68DE3 2245 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD4-210ENST00000590061 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.14□□□□□ -1.43
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