RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 COQ2Q96H96 371 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 MEIKINA0A087WXM9 373 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 GPR137BO60478 399 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 CLPXO76031 633 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 CDK2P24941 298 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 RPS25P62851 125 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 TPBGQ13641 420 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 TAF9Q16594 264 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 BEND2Q8NDZ0 799 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.16□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 MGLLQ99685 303 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 SSX3Q99909 188 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 BARHL1Q9BZE3 327 aa11.16□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 TAS2R3Q9NYW6 316 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 OR6C3Q9NZP0 311 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 KIF25Q9UIL4 384 aa11.16□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 MMP23AO75900 390 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 CPEP16870 476 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 SRMP19623 302 aa11.15□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 GLP1RP43220 463 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 GP2P55259 537 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 PLA1AQ53H76 456 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 NHLRC3Q5JS37 347 aa11.15□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 LINC00596Q86U02 117 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 ZNF565Q8N9K5 539 aa11.15□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 UQCC2Q9BRT2 126 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 SLITRK2Q9H156 845 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 BANF2Q9H503 90 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-207ENST00000589585 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.14□□□□□ -0.63
CTIF-207ENST00000589585 FAM172BPA6NC97 362 aa11.14□□□□□ -0.63
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CTIF-207ENST00000589585 FAM46BQ96A09 425 aa11.14□□□□□ -0.63
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CTIF-207ENST00000589585 C1RLQ9NZP8 487 aa11.14□□□□□ -0.63
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CTIF-207ENST00000589585 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTIF-207ENST00000589585 ODF3BA8MYP8 253 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-207ENST00000589585 SC5DO75845 299 aa11.13□□□□□ -0.63
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CTIF-207ENST00000589585 MGMTP16455 207 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-207ENST00000589585 MDKP21741 143 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTIF-207ENST00000589585 NFYBP25208 207 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-207ENST00000589585 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
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CTIF-207ENST00000589585 RAG2P55895 527 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-207ENST00000589585 GABARAPL2P60520 117 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-207ENST00000589585 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTIF-207ENST00000589585 FAM189A2Q15884 450 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-207ENST00000589585 LY6EQ16553 131 aa11.13□□□□□ -0.63
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