RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589055.3

TMEM259-206, Transcript of transmembrane protein 259, human

TSL 3

Gene TMEM259, Length 791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-206	ENST00000589055	LEAP2	Q969E1	77 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	RHOF	Q9HBH0	211 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	MAGEB3	O15480	346 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	OGG1	O15527	345 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	NFYB	P25208	207 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	BDH1	Q02338	343 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	RSU1	Q15404	277 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	LTC4S	Q16873	150 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	DDI2	Q5TDH0	399 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	C11orf88	Q6PI97	169 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	GGH	Q92820	318 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	SMIM19	Q96E16	107 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	DPM3	Q9P2X0	92 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055		A0A1W2PP11	408 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	FBXO24	O75426	580 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CD2	P06729	351 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	MYL12A	P19105	171 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CD34	P28906	385 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	IL13RA2	Q14627	380 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	TTC23	Q5W5X9	447 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	OR52W1	Q6IF63	320 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF596	Q8TC21	504 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	GHSR	Q92847	366 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	TMEM80	Q96HE8	168 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	KIRREL1	Q96J84	757 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CALY	Q9NYX4	217 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ING4	Q9UNL4	249 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055		A0A1W2PPK0	400 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	XPNPEP2	O43895	674 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CGB3	P0DN86	165 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CGB7	P0DN87	165 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	SERPINA2	P20848	420 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	SSTR5	P35346	364 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	PPP3R1	P63098	170 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ASCL4	Q6XD76	172 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	RFESD	Q8TAC1	157 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CYYR1	Q96J86	154 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM259-206	ENST00000589055	IRGM	A1A4Y4	181 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	LEUTX	A8MZ59	168 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055		G3V4G9	280 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	LY6L	H3BQJ8	138 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	TOR1A	O14656	332 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	ALDOB	P05062	364 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	BDKRB2	P30411	391 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	GNG10	P50151	68 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	ST3GAL4	Q11206	333 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	SETD9	Q8NE22	299 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055		Q8NFD4	153 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	OR52N1	Q8NH53	320 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	UBALD1	Q8TB05	177 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TMEM259-206	ENST00000589055	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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