RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 EFNB3Q15768 340 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 ADIPOQQ15848 244 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 TATDN3Q17R31 274 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 SLC22A25Q6T423 547 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 WDR82Q6UXN9 313 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 GLCCI1Q86VQ1 547 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 BPIFB2Q8N4F0 458 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 BEST4Q8NFU0 473 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 OR5AP2Q8NGF4 316 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 OR4D10Q8NGI6 311 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 OR51S1Q8NGJ8 323 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 GHITMQ9H3K2 345 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 MSL2Q9HCI7 577 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 C12orf4Q9NQ89 552 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 MCUBQ9NWR8 336 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 TAAR3PQ9P1P4 343 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 AK3Q9UIJ7 227 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 FZR1Q9UM11 496 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 TENM1Q9UKZ4 2725 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 MCRIP1C9JLW8 97 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 KNG1P01042 644 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 LHBP01229 141 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 OR4A8P0C604 315 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 ZNF81P51508 661 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 SNU13P55769 128 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 PAX5Q02548 391 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 OR2Z1Q8NG97 314 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 OR4S1Q8NGB4 309 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 Q8TCH9 128 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 ELMOD3Q96FG2 381 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 SLC6A7Q99884 636 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 C20orf85Q9H1P6 137 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 DECR2Q9NUI1 292 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 ZNF581Q9P0T4 197 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 ATP23Q9Y6H3 246 aa10.03□□□□□ -0.8
GGA3-217ENST00000583667 TRAV24A0A0B4J272 114 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 SNRPGP15A8MWD9 76 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 SRRM5B3KS81 715 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 SH2D1BO14796 132 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 DEGS1O15121 323 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 AMY2AP04746 511 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 FCER2P06734 321 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 CD3EP07766 207 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 FCGR3AP08637 254 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 PAX1P15863 534 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 EGR1P18146 543 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 AMY2BP19961 511 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 TNFSF4P23510 183 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 HRH1P35367 487 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 MDH2P40926 338 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 KCNJ3P48549 501 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 MPPED2Q15777 294 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 MICBQ29980 383 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 FAM209AQ5JX71 171 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 METTL11BQ5VVY1 283 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 OR52W1Q6IF63 320 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 ADAM5Q6NVV9 412 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 ZNF880Q6PDB4 577 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 DHRS11Q6UWP2 260 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 LHFPL1Q86WI0 220 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 TMEM17Q86X19 198 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 SUMF2Q8NBJ7 301 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 OR13C8Q8NGS7 320 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 TERB2Q8NHR7 220 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 PLPPR2Q96GM1 343 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 ZNF488Q96MN9 340 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 DHRS9Q9BPW9 319 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 SYT3Q9BQG1 590 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 REG4Q9BYZ8 158 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 FN3KRPQ9HA64 309 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 GLS2Q9UI32 602 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 ANXA10Q9UJ72 324 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 ALG5Q9Y673 324 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 USF3Q68DE3 2245 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 TRAV6A0A075B6T7 132 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-217ENST00000583667 A0A0A6YYJ9 748 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms